ژنوتایپینگ و فنوتایپینگ می توانند مقاومت در برابر مواد مخدر را شناسایی و حتی پیش بینی کنند
حتی برای افرادی که به درمان مناسب می اندیشند، به علت جهش های طبیعی ویروس، برخی از میزان مقاومت به مواد مخدر در اواخر، با گذشت زمان افزایش می یابد. در موارد دیگر، مقاومت به طور سریع می تواند رشد کند، در حالی که پیوستگی های غیرپتیمال اجازه می دهد که جمعیت های مقاوم در برابر HIV رشد کنند، و در نهایت منجر به نارسایی های درمان می شود.
هنگامی که نارسایی ناشی از درمان رخ می دهد، ترکیبات متداول دارو باید به منظور سرکوب این جمعیت جدید ویروس مقاوم باشد.
تست مقاومت ژنتیکی با شناسایی انواع جهش های مقاوم در یک استخر ویروسی، این موضوع را تسهیل می کند، در حالیکه مشخص می کند که چگونه این ویروس ها به عوامل قابل antiretroviral قابل اطمینان هستند .
دو تست اصلی برای آزمایش مقاومت در برابر ژنتیک در HIV استفاده می شود: تست ژنتیکی اچ آی وی و تست فنوتیپ اچ .
یک ژنوتیپ و یک فنوتیپ چیست؟
با تعریف، یک ژنوتیپ به سادگی آرایش ژنتیکی یک ارگانیسم است، در حالی که یک فنوتیپ مشخصه های قابل مشاهده یا صفات آن ارگانیسم است.
تست ژنوتیپ (یا ژنوتیپ) با شناسایی دستورالعمل های ارثی در کدگذاری ژنتیکی سلولی یا DNA انجام می شود. تستهای فنوتیپی (یا فنوتیپی) بیان این دستورالعمل را تحت تأثیر شرایط محیطی مختلف تایید می کنند.
در حالی که ارتباط بین ژنوتیپ و فنوتیپ مطلق نیست، ژنوتیپ اغلب می تواند پیش بینی فنوتیپ، به ویژه هنگامی که تغییرات در کد ژنتیک به تغییرات مورد انتظار در صفات و ویژگی ها کمک می کند، همانطور که در مورد مقاومت در برابر داروها.
از سوی دیگر، فنوتایپینگ "اینجا و اکنون" را تایید می کند. هدف از این مطالعه ارزیابی واکنش ارگانیسم به تغییرات خاص در فشار محیطی است مانند زمانی که HIV در معرض داروهای مختلف و / یا غلظت دارو قرار دارد.
توضیح ژنوتیپ اچ
ژنوتایپ اچ آی وی به طور کلی رایج ترین فن آوری مورد استفاده برای آزمایش مقاومت است.
هدف از این آزمایش تشخیص جهش های ژنتیکی خاص در ناحیه gag-pol ژنوم ویروس (یا کد ژنتیکی) است. این منطقه ای است که در آن پروتئین و پروتئاز معکوس آنزیم ها - اهداف بیشتر داروهای ضد رتروویروسی - کدگذاری شده در زنجیره DNA است.
با تکمیل اولین ژنوم اچ آی وی با استفاده از فن آوری واکنش زنجیره ای پلیمریزاسیون (PCR) ، تکنسین های آزمایشگاهی می توانند ژنتیک ویروس را با استفاده از تکنولوژی های تشخیص جهش های مختلف (یا "نقشه") نشان دهند.
این جهش ها (یا انباشت جهش ها) توسط تکنسین هایی که تجزیه و تحلیل رابطه بین جهش های شناسایی شده و حساسیت پذیری ویروس به داروهای ضد رتروویروسی مختلف را تفسیر می کنند، تفسیر می شود. پایگاه های داده آنلاین می توانند با مقایسه تست تست با نمونه اولیه ویروس "نوع وحشی" (یعنی HIV که شامل هیچ جهش مقاومتی) نباشند.
تفسیر این آزمایش ها برای تعیین حساسیت به مواد مخدر، با تعداد بیشتری جهش های کلیدی که موجب افزایش مقاومت به مواد می شود، استفاده می شود .
توضیح دادن Phenoytyping اچ آی وی
فنیتیپینگ HIV بر رشد HIV فرد در حضور یک دارو ارزیابی می کند و سپس آن را با رشد یک ویروس کنترل، نوع وحشی در همان دارو مقایسه می کند.
همانطور که در آزمایشات ژنوتایپی، آزمایش فنوتیپی، منطقه gag-pol ژنوم HIV را تقویت می کند.
این بخش از کد ژنتیک سپس به یک تکنولوژی DNA نوترکیب بر روی یک کلون وحشی تبدیل می شود . ویروس نوترکیب به دست آمده برای آلوده سازی سلول های پستانداران در آزمایشگاهی (در آزمایشگاه) استفاده می شود.
سپس نمونه ویروسی در معرض افزایش غلظت داروهای ضد رتروویروسی مختلف تا 50٪ و 90٪ سرکوب ویروسی قرار می گیرد. سپس غلظت ها به نتایج حاصل از نمونه شاهد وحشی مقایسه می شود.
تغییرات نسبی "برابر" دامنه ارزش را تعیین می کند که حساسیت دارو را تعیین می کند. تغییر چهار برابر به سادگی نشان می دهد که چهار برابر مقدار دارو برای دستیابی به سرکوب ویروسی در مقایسه با نوع وحشی مورد نیاز است.
مقدار ارزش برابر، مقدار کمتر حساس به ویروس به یک دارو خاص است.
سپس این مقادیر در محدوده بالینی بالینی و بالینی بالینی قرار می گیرند و مقادیر بالای آن به سطوح بالاتر مقاومت درمانی می رسند. ( گزارش نمونه را ببینید.)
هنگامی که یک آزمایش مقاومت ژنتیکی انجام می شود؟
در ایالات متحده، آزمایش مقاومت در برابر ژنتیک به طور سنتی بر روی بیماران مبتلا به سکته مغزی انجام می شود تا تعیین کنند که آیا آنها "مقاومت" دارویی "به دست آمده" داشته باشند. مطالعات در ایالات متحده نشان می دهد که بین 6 تا 16 درصد از ویروس منتقل شده به یک دارو ضد رتروویروسی مقاوم خواهد بود، در حالی که نزدیک به 5 درصد به بیش از یک طبقه از داروها مقاوم خواهد بود.
تست مقاومت ژنتیکی همچنین زمانی استفاده می شود که مقاومت در برابر داروها در افراد در معرض خطر باشد. تست انجام می شود در حالی که بیمار در حال مصرف رژیم های شکست خورده است و یا در عرض چهار هفته پس از قطع درمان اگر میزان ویروسی بیش از 500 نسخه در میلی لیتر باشد. آزمايش ژنوتيپي به طور كلي در اين موارد ترجیح داده می شود، زيرا آنها كمتر هزینه می كنند، زمان چرخش سریعتری دارند و حساسیت بیشتری برای تشخیص مخلوط ویروس وحشی و مقاوم دارند.
ترکیبی از آزمایش فنوتیپیک و ژنوتیپ معمولا برای افرادی که دارای پیچیدگی و مقاومت چند داروئی هستند، مخصوصا برای افرادی که در معرض مهارکننده های پروتئاز قرار دارند، ترجیح داده می شود .
منابع:
سازمان بهداشت جهانی (WHO). "شماره فاکتور مقاومت در برابر مواد مخدر". ژنو، سوئیس؛ 11 آوریل 2011
کیم، د. Ziebell، R .؛ Saduvala، N .؛ و همکاران "روند در جهش های مرتبط با مقاومت دارویی HIV-1 منتسب به HIV: 10 ناحیه مراقبت های ویژه ایدز، ایالات متحده، 2007-2010." کنفرانس 20 در مورد رتروویروس ها و عفونت های فرصت های شغلی. آتلانتا، جورجیا؛ 6 مارس 2013؛ انتزاعی شفاهی 149.
مؤسسات ملی بهداشت (NIH). "دستورالعمل استفاده از عوامل ضد رتروویروم در بزرگسالان و نوجوانان مبتلا به HIV-1". بتسدا، مریلند؛ 2013 اکتبر 11.